Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PLXNC1O60486 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PLXNC1O60486 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PLXNC1O60486 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PLXNC1O60486 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PLXNC1O60486 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PLXNC1O60486 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PLXNC1O60486 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PLXNC1O60486 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PLXNC1O60486 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PLXNC1O60486 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PLXNC1O60486 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PLXNC1O60486 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PLXNC1O60486 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PLXNC1O60486 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PLXNC1O60486 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PLXNC1O60486 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PLXNC1O60486 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PLXNC1O60486 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PLXNC1O60486 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PLXNC1O60486 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PLXNC1O60486 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PLXNC1O60486 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PLXNC1O60486 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PLXNC1O60486 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PLXNC1O60486 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PLXNC1O60486 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PLXNC1O60486 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PLXNC1O60486 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PLXNC1O60486 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PLXNC1O60486 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PLXNC1O60486 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PLXNC1O60486 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PLXNC1O60486 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PLXNC1O60486 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PLXNC1O60486 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PLXNC1O60486 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PLXNC1O60486 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PLXNC1O60486 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PLXNC1O60486 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PLXNC1O60486 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PLXNC1O60486 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PLXNC1O60486 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PLXNC1O60486 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PLXNC1O60486 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PLXNC1O60486 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PLXNC1O60486 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PLXNC1O60486 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PLXNC1O60486 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PLXNC1O60486 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
PLXNC1O60486 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
PLXNC1O60486 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PLXNC1O60486 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PLXNC1O60486 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PLXNC1O60486 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PLXNC1O60486 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PLXNC1O60486 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PLXNC1O60486 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PLXNC1O60486 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PLXNC1O60486 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PLXNC1O60486 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PLXNC1O60486 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PLXNC1O60486 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PLXNC1O60486 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PLXNC1O60486 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PLXNC1O60486 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PLXNC1O60486 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
PLXNC1O60486 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PLXNC1O60486 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PLXNC1O60486 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PLXNC1O60486 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PLXNC1O60486 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PLXNC1O60486 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
PLXNC1O60486 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PLXNC1O60486 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PLXNC1O60486 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PLXNC1O60486 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PLXNC1O60486 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PLXNC1O60486 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PLXNC1O60486 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PLXNC1O60486 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PLXNC1O60486 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PLXNC1O60486 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PLXNC1O60486 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PLXNC1O60486 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PLXNC1O60486 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PLXNC1O60486 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PLXNC1O60486 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PLXNC1O60486 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PLXNC1O60486 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PLXNC1O60486 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PLXNC1O60486 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PLXNC1O60486 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PLXNC1O60486 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PLXNC1O60486 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PLXNC1O60486 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PLXNC1O60486 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PLXNC1O60486 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PLXNC1O60486 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PLXNC1O60486 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms