Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CRXO43186 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CRXO43186 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CRXO43186 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CRXO43186 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CRXO43186 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CRXO43186 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CRXO43186 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CRXO43186 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CRXO43186 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CRXO43186 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CRXO43186 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CRXO43186 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CRXO43186 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CRXO43186 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CRXO43186 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CRXO43186 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CRXO43186 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CRXO43186 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CRXO43186 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CRXO43186 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CRXO43186 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CRXO43186 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CRXO43186 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CRXO43186 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CRXO43186 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CRXO43186 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CRXO43186 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CRXO43186 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CRXO43186 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CRXO43186 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CRXO43186 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CRXO43186 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CRXO43186 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CRXO43186 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CRXO43186 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CRXO43186 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CRXO43186 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CRXO43186 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CRXO43186 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CRXO43186 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CRXO43186 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CRXO43186 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CRXO43186 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CRXO43186 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CRXO43186 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CRXO43186 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CRXO43186 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CRXO43186 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CRXO43186 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CRXO43186 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CRXO43186 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CRXO43186 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CRXO43186 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CRXO43186 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CRXO43186 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CRXO43186 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CRXO43186 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CRXO43186 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CRXO43186 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CRXO43186 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CRXO43186 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CRXO43186 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CRXO43186 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CRXO43186 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CRXO43186 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CRXO43186 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CRXO43186 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CRXO43186 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CRXO43186 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CRXO43186 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CRXO43186 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CRXO43186 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CRXO43186 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CRXO43186 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CRXO43186 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CRXO43186 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CRXO43186 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CRXO43186 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CRXO43186 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CRXO43186 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CRXO43186 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CRXO43186 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CRXO43186 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CRXO43186 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CRXO43186 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CRXO43186 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CRXO43186 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CRXO43186 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CRXO43186 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CRXO43186 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CRXO43186 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CRXO43186 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CRXO43186 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CRXO43186 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CRXO43186 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
CRXO43186 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CRXO43186 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CRXO43186 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CRXO43186 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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