Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FANCAO15360 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
FANCAO15360 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FANCAO15360 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FANCAO15360 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FANCAO15360 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FANCAO15360 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FANCAO15360 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
FANCAO15360 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FANCAO15360 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FANCAO15360 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FANCAO15360 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FANCAO15360 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FANCAO15360 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FANCAO15360 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FANCAO15360 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FANCAO15360 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FANCAO15360 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
FANCAO15360 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FANCAO15360 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FANCAO15360 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FANCAO15360 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FANCAO15360 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FANCAO15360 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FANCAO15360 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FANCAO15360 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
FANCAO15360 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FANCAO15360 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FANCAO15360 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
FANCAO15360 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FANCAO15360 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FANCAO15360 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FANCAO15360 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FANCAO15360 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FANCAO15360 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FANCAO15360 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FANCAO15360 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FANCAO15360 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FANCAO15360 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FANCAO15360 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FANCAO15360 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FANCAO15360 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FANCAO15360 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FANCAO15360 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FANCAO15360 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FANCAO15360 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FANCAO15360 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FANCAO15360 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FANCAO15360 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
FANCAO15360 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FANCAO15360 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
FANCAO15360 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FANCAO15360 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FANCAO15360 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FANCAO15360 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FANCAO15360 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FANCAO15360 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FANCAO15360 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FANCAO15360 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FANCAO15360 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FANCAO15360 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FANCAO15360 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FANCAO15360 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FANCAO15360 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
FANCAO15360 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FANCAO15360 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FANCAO15360 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FANCAO15360 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FANCAO15360 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FANCAO15360 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
FANCAO15360 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FANCAO15360 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FANCAO15360 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC28■■■□□ 2.07
FANCAO15360 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
FANCAO15360 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
FANCAO15360 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
FANCAO15360 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
FANCAO15360 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
FANCAO15360 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
FANCAO15360 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FANCAO15360 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FANCAO15360 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FANCAO15360 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
FANCAO15360 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
FANCAO15360 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FANCAO15360 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FANCAO15360 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FANCAO15360 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FANCAO15360 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FANCAO15360 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FANCAO15360 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FANCAO15360 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FANCAO15360 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FANCAO15360 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FANCAO15360 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FANCAO15360 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
FANCAO15360 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FANCAO15360 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FANCAO15360 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
FANCAO15360 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms