Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
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CEP290O15078 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEP290O15078 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEP290O15078 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEP290O15078 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEP290O15078 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEP290O15078 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEP290O15078 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEP290O15078 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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CEP290O15078 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEP290O15078 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEP290O15078 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
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CEP290O15078 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEP290O15078 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
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CEP290O15078 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
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CEP290O15078 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
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CEP290O15078 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEP290O15078 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEP290O15078 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
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CEP290O15078 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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CEP290O15078 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEP290O15078 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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CEP290O15078 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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CEP290O15078 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CEP290O15078 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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CEP290O15078 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CEP290O15078 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CEP290O15078 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CEP290O15078 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CEP290O15078 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CEP290O15078 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CEP290O15078 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CEP290O15078 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CEP290O15078 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CEP290O15078 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.8
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