Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYNMO15061 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYNMO15061 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYNMO15061 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYNMO15061 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SYNMO15061 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SYNMO15061 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYNMO15061 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYNMO15061 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYNMO15061 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYNMO15061 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYNMO15061 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SYNMO15061 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYNMO15061 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYNMO15061 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYNMO15061 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYNMO15061 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SYNMO15061 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SYNMO15061 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYNMO15061 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SYNMO15061 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNMO15061 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNMO15061 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNMO15061 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNMO15061 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNMO15061 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNMO15061 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNMO15061 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNMO15061 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNMO15061 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNMO15061 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNMO15061 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNMO15061 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNMO15061 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNMO15061 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNMO15061 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SYNMO15061 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYNMO15061 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYNMO15061 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYNMO15061 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SYNMO15061 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYNMO15061 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYNMO15061 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SYNMO15061 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYNMO15061 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYNMO15061 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYNMO15061 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYNMO15061 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYNMO15061 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SYNMO15061 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYNMO15061 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYNMO15061 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYNMO15061 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYNMO15061 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYNMO15061 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYNMO15061 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYNMO15061 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYNMO15061 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYNMO15061 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYNMO15061 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYNMO15061 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYNMO15061 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYNMO15061 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYNMO15061 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SYNMO15061 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYNMO15061 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYNMO15061 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYNMO15061 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SYNMO15061 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SYNMO15061 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SYNMO15061 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYNMO15061 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYNMO15061 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYNMO15061 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYNMO15061 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYNMO15061 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYNMO15061 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYNMO15061 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYNMO15061 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYNMO15061 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYNMO15061 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYNMO15061 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYNMO15061 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYNMO15061 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYNMO15061 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYNMO15061 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYNMO15061 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYNMO15061 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYNMO15061 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYNMO15061 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYNMO15061 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SYNMO15061 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SYNMO15061 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYNMO15061 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SYNMO15061 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYNMO15061 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYNMO15061 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYNMO15061 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYNMO15061 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYNMO15061 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms