Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP17L13C9JLJ4 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms