Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CFAP73A6NFT4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms