Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
E2F8A0AVK6 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
E2F8A0AVK6 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
E2F8A0AVK6 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
E2F8A0AVK6 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
E2F8A0AVK6 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F8A0AVK6 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F8A0AVK6 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F8A0AVK6 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F8A0AVK6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F8A0AVK6 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F8A0AVK6 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F8A0AVK6 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F8A0AVK6 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F8A0AVK6 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F8A0AVK6 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F8A0AVK6 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F8A0AVK6 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F8A0AVK6 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F8A0AVK6 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F8A0AVK6 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F8A0AVK6 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F8A0AVK6 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F8A0AVK6 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F8A0AVK6 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F8A0AVK6 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F8A0AVK6 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F8A0AVK6 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F8A0AVK6 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F8A0AVK6 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F8A0AVK6 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F8A0AVK6 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F8A0AVK6 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F8A0AVK6 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F8A0AVK6 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F8A0AVK6 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F8A0AVK6 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F8A0AVK6 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F8A0AVK6 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F8A0AVK6 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F8A0AVK6 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F8A0AVK6 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F8A0AVK6 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F8A0AVK6 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F8A0AVK6 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F8A0AVK6 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F8A0AVK6 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F8A0AVK6 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F8A0AVK6 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F8A0AVK6 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F8A0AVK6 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F8A0AVK6 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F8A0AVK6 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F8A0AVK6 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F8A0AVK6 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F8A0AVK6 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F8A0AVK6 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F8A0AVK6 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F8A0AVK6 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F8A0AVK6 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F8A0AVK6 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F8A0AVK6 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F8A0AVK6 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F8A0AVK6 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F8A0AVK6 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F8A0AVK6 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F8A0AVK6 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F8A0AVK6 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F8A0AVK6 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F8A0AVK6 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F8A0AVK6 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F8A0AVK6 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F8A0AVK6 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F8A0AVK6 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F8A0AVK6 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F8A0AVK6 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F8A0AVK6 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F8A0AVK6 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F8A0AVK6 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F8A0AVK6 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F8A0AVK6 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F8A0AVK6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F8A0AVK6 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F8A0AVK6 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F8A0AVK6 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F8A0AVK6 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F8A0AVK6 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F8A0AVK6 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
E2F8A0AVK6 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
E2F8A0AVK6 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
E2F8A0AVK6 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
E2F8A0AVK6 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
E2F8A0AVK6 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
E2F8A0AVK6 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
E2F8A0AVK6 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
E2F8A0AVK6 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
E2F8A0AVK6 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
E2F8A0AVK6 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
E2F8A0AVK6 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
E2F8A0AVK6 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms