Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GTF3C3Q9Y5Q9 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms