Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLXND1Q9Y4D7 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLXND1Q9Y4D7 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLXND1Q9Y4D7 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLXND1Q9Y4D7 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLXND1Q9Y4D7 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLXND1Q9Y4D7 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLXND1Q9Y4D7 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLXND1Q9Y4D7 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLXND1Q9Y4D7 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PLXND1Q9Y4D7 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PLXND1Q9Y4D7 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PLXND1Q9Y4D7 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLXND1Q9Y4D7 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLXND1Q9Y4D7 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PLXND1Q9Y4D7 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLXND1Q9Y4D7 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLXND1Q9Y4D7 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLXND1Q9Y4D7 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PLXND1Q9Y4D7 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLXND1Q9Y4D7 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLXND1Q9Y4D7 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PLXND1Q9Y4D7 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PLXND1Q9Y4D7 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLXND1Q9Y4D7 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLXND1Q9Y4D7 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLXND1Q9Y4D7 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLXND1Q9Y4D7 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PLXND1Q9Y4D7 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLXND1Q9Y4D7 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLXND1Q9Y4D7 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLXND1Q9Y4D7 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLXND1Q9Y4D7 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLXND1Q9Y4D7 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLXND1Q9Y4D7 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLXND1Q9Y4D7 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLXND1Q9Y4D7 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLXND1Q9Y4D7 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLXND1Q9Y4D7 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLXND1Q9Y4D7 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLXND1Q9Y4D7 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLXND1Q9Y4D7 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLXND1Q9Y4D7 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLXND1Q9Y4D7 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PLXND1Q9Y4D7 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLXND1Q9Y4D7 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLXND1Q9Y4D7 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PLXND1Q9Y4D7 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PLXND1Q9Y4D7 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PLXND1Q9Y4D7 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PLXND1Q9Y4D7 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PLXND1Q9Y4D7 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PLXND1Q9Y4D7 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PLXND1Q9Y4D7 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PLXND1Q9Y4D7 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PLXND1Q9Y4D7 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PLXND1Q9Y4D7 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PLXND1Q9Y4D7 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PLXND1Q9Y4D7 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PLXND1Q9Y4D7 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PLXND1Q9Y4D7 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PLXND1Q9Y4D7 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PLXND1Q9Y4D7 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PLXND1Q9Y4D7 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PLXND1Q9Y4D7 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PLXND1Q9Y4D7 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PLXND1Q9Y4D7 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PLXND1Q9Y4D7 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PLXND1Q9Y4D7 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PLXND1Q9Y4D7 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PLXND1Q9Y4D7 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PLXND1Q9Y4D7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PLXND1Q9Y4D7 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms