Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
RAD54L2Q9Y4B4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.9■■■□□ 2.54
RAD54L2Q9Y4B4 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
RAD54L2Q9Y4B4 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
RAD54L2Q9Y4B4 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
RAD54L2Q9Y4B4 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
RAD54L2Q9Y4B4 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
RAD54L2Q9Y4B4 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
RAD54L2Q9Y4B4 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
RAD54L2Q9Y4B4 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
RAD54L2Q9Y4B4 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
RAD54L2Q9Y4B4 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
RAD54L2Q9Y4B4 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
RAD54L2Q9Y4B4 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
RAD54L2Q9Y4B4 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
RAD54L2Q9Y4B4 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
RAD54L2Q9Y4B4 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
RAD54L2Q9Y4B4 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
RAD54L2Q9Y4B4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
RAD54L2Q9Y4B4 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
RAD54L2Q9Y4B4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
RAD54L2Q9Y4B4 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
RAD54L2Q9Y4B4 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.53
RAD54L2Q9Y4B4 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.53
RAD54L2Q9Y4B4 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
RAD54L2Q9Y4B4 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC30.89■■■□□ 2.53
RAD54L2Q9Y4B4 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC30.89■■■□□ 2.53
RAD54L2Q9Y4B4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
RAD54L2Q9Y4B4 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
RAD54L2Q9Y4B4 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
RAD54L2Q9Y4B4 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
RAD54L2Q9Y4B4 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
RAD54L2Q9Y4B4 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
RAD54L2Q9Y4B4 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
RAD54L2Q9Y4B4 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
RAD54L2Q9Y4B4 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
RAD54L2Q9Y4B4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
RAD54L2Q9Y4B4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
RAD54L2Q9Y4B4 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
RAD54L2Q9Y4B4 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
RAD54L2Q9Y4B4 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
RAD54L2Q9Y4B4 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
RAD54L2Q9Y4B4 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
RAD54L2Q9Y4B4 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
RAD54L2Q9Y4B4 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
RAD54L2Q9Y4B4 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
RAD54L2Q9Y4B4 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
RAD54L2Q9Y4B4 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
RAD54L2Q9Y4B4 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
RAD54L2Q9Y4B4 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
RAD54L2Q9Y4B4 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
RAD54L2Q9Y4B4 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
RAD54L2Q9Y4B4 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
RAD54L2Q9Y4B4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
RAD54L2Q9Y4B4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
RAD54L2Q9Y4B4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
RAD54L2Q9Y4B4 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
RAD54L2Q9Y4B4 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
RAD54L2Q9Y4B4 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
RAD54L2Q9Y4B4 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
RAD54L2Q9Y4B4 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
RAD54L2Q9Y4B4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
RAD54L2Q9Y4B4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
RAD54L2Q9Y4B4 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
RAD54L2Q9Y4B4 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
RAD54L2Q9Y4B4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
RAD54L2Q9Y4B4 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
RAD54L2Q9Y4B4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
RAD54L2Q9Y4B4 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
RAD54L2Q9Y4B4 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
RAD54L2Q9Y4B4 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
RAD54L2Q9Y4B4 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
RAD54L2Q9Y4B4 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
RAD54L2Q9Y4B4 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
RAD54L2Q9Y4B4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
RAD54L2Q9Y4B4 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
RAD54L2Q9Y4B4 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
RAD54L2Q9Y4B4 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
RAD54L2Q9Y4B4 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
RAD54L2Q9Y4B4 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
RAD54L2Q9Y4B4 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
RAD54L2Q9Y4B4 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
RAD54L2Q9Y4B4 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
RAD54L2Q9Y4B4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RAD54L2Q9Y4B4 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RAD54L2Q9Y4B4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
RAD54L2Q9Y4B4 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
RAD54L2Q9Y4B4 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
RAD54L2Q9Y4B4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RAD54L2Q9Y4B4 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RAD54L2Q9Y4B4 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
RAD54L2Q9Y4B4 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
RAD54L2Q9Y4B4 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
RAD54L2Q9Y4B4 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.53
RAD54L2Q9Y4B4 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.53
RAD54L2Q9Y4B4 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC30.82■■■□□ 2.53
RAD54L2Q9Y4B4 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.53
RAD54L2Q9Y4B4 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms