Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y275

TNFSF13B, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF13BQ9Y275 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFSF13BQ9Y275 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFSF13BQ9Y275 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFSF13BQ9Y275 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
TNFSF13BQ9Y275 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFSF13BQ9Y275 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms