Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX3

MYH13, Myosin-13, humanhuman

Predictions only

Length 1,938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH13Q9UKX3 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYH13Q9UKX3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYH13Q9UKX3 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYH13Q9UKX3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYH13Q9UKX3 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYH13Q9UKX3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYH13Q9UKX3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYH13Q9UKX3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYH13Q9UKX3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYH13Q9UKX3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYH13Q9UKX3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYH13Q9UKX3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYH13Q9UKX3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYH13Q9UKX3 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYH13Q9UKX3 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYH13Q9UKX3 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYH13Q9UKX3 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYH13Q9UKX3 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYH13Q9UKX3 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYH13Q9UKX3 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYH13Q9UKX3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYH13Q9UKX3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYH13Q9UKX3 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYH13Q9UKX3 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYH13Q9UKX3 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYH13Q9UKX3 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYH13Q9UKX3 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYH13Q9UKX3 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MYH13Q9UKX3 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYH13Q9UKX3 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MYH13Q9UKX3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYH13Q9UKX3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYH13Q9UKX3 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYH13Q9UKX3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYH13Q9UKX3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYH13Q9UKX3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYH13Q9UKX3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYH13Q9UKX3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYH13Q9UKX3 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MYH13Q9UKX3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYH13Q9UKX3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYH13Q9UKX3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYH13Q9UKX3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYH13Q9UKX3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYH13Q9UKX3 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYH13Q9UKX3 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYH13Q9UKX3 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYH13Q9UKX3 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYH13Q9UKX3 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYH13Q9UKX3 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYH13Q9UKX3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYH13Q9UKX3 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYH13Q9UKX3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYH13Q9UKX3 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYH13Q9UKX3 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MYH13Q9UKX3 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYH13Q9UKX3 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYH13Q9UKX3 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYH13Q9UKX3 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYH13Q9UKX3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYH13Q9UKX3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MYH13Q9UKX3 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYH13Q9UKX3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MYH13Q9UKX3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MYH13Q9UKX3 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
MYH13Q9UKX3 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
MYH13Q9UKX3 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MYH13Q9UKX3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MYH13Q9UKX3 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
MYH13Q9UKX3 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
MYH13Q9UKX3 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MYH13Q9UKX3 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MYH13Q9UKX3 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MYH13Q9UKX3 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MYH13Q9UKX3 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MYH13Q9UKX3 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MYH13Q9UKX3 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MYH13Q9UKX3 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MYH13Q9UKX3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MYH13Q9UKX3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MYH13Q9UKX3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MYH13Q9UKX3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYH13Q9UKX3 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYH13Q9UKX3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYH13Q9UKX3 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYH13Q9UKX3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYH13Q9UKX3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYH13Q9UKX3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYH13Q9UKX3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYH13Q9UKX3 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYH13Q9UKX3 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MYH13Q9UKX3 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYH13Q9UKX3 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYH13Q9UKX3 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MYH13Q9UKX3 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYH13Q9UKX3 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYH13Q9UKX3 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYH13Q9UKX3 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYH13Q9UKX3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYH13Q9UKX3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms