Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNNA3Q9UI47 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms