Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHORDC1Q9UHD1 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHORDC1Q9UHD1 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms