Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DKK4Q9UBT3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms