Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC38.01■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC38.01■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC38.01■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC38.01■■■■□ 3.68
CCDC180Q9P1Z9 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
CCDC180Q9P1Z9 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
CCDC180Q9P1Z9 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
CCDC180Q9P1Z9 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.67
CCDC180Q9P1Z9 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.67
CCDC180Q9P1Z9 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC38.01■■■■□ 3.67
CCDC180Q9P1Z9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
CCDC180Q9P1Z9 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
CCDC180Q9P1Z9 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
CCDC180Q9P1Z9 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
CCDC180Q9P1Z9 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
CCDC180Q9P1Z9 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
CCDC180Q9P1Z9 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
CCDC180Q9P1Z9 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
CCDC180Q9P1Z9 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC38■■■■□ 3.67
CCDC180Q9P1Z9 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC38■■■■□ 3.67
CCDC180Q9P1Z9 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
CCDC180Q9P1Z9 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
CCDC180Q9P1Z9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC38■■■■□ 3.67
CCDC180Q9P1Z9 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
CCDC180Q9P1Z9 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
CCDC180Q9P1Z9 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
CCDC180Q9P1Z9 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
CCDC180Q9P1Z9 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
CCDC180Q9P1Z9 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
CCDC180Q9P1Z9 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
CCDC180Q9P1Z9 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
CCDC180Q9P1Z9 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
CCDC180Q9P1Z9 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
CCDC180Q9P1Z9 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
CCDC180Q9P1Z9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
CCDC180Q9P1Z9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
CCDC180Q9P1Z9 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
CCDC180Q9P1Z9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
CCDC180Q9P1Z9 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
CCDC180Q9P1Z9 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
CCDC180Q9P1Z9 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
CCDC180Q9P1Z9 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
CCDC180Q9P1Z9 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
CCDC180Q9P1Z9 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
CCDC180Q9P1Z9 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
CCDC180Q9P1Z9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
CCDC180Q9P1Z9 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
CCDC180Q9P1Z9 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.98■■■■□ 3.67
CCDC180Q9P1Z9 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC37.98■■■■□ 3.67
CCDC180Q9P1Z9 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
CCDC180Q9P1Z9 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
CCDC180Q9P1Z9 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
CCDC180Q9P1Z9 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
CCDC180Q9P1Z9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
CCDC180Q9P1Z9 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
CCDC180Q9P1Z9 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
CCDC180Q9P1Z9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
CCDC180Q9P1Z9 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
CCDC180Q9P1Z9 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
CCDC180Q9P1Z9 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
CCDC180Q9P1Z9 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
CCDC180Q9P1Z9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
CCDC180Q9P1Z9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
CCDC180Q9P1Z9 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
CCDC180Q9P1Z9 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
CCDC180Q9P1Z9 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
CCDC180Q9P1Z9 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
CCDC180Q9P1Z9 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
CCDC180Q9P1Z9 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
CCDC180Q9P1Z9 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
CCDC180Q9P1Z9 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
CCDC180Q9P1Z9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
CCDC180Q9P1Z9 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
CCDC180Q9P1Z9 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
CCDC180Q9P1Z9 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
CCDC180Q9P1Z9 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
CCDC180Q9P1Z9 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
CCDC180Q9P1Z9 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
CCDC180Q9P1Z9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
CCDC180Q9P1Z9 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
CCDC180Q9P1Z9 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
CCDC180Q9P1Z9 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.94■■■■□ 3.66
CCDC180Q9P1Z9 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
CCDC180Q9P1Z9 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
CCDC180Q9P1Z9 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC37.94■■■■□ 3.66
CCDC180Q9P1Z9 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
CCDC180Q9P1Z9 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
CCDC180Q9P1Z9 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
CCDC180Q9P1Z9 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
CCDC180Q9P1Z9 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
CCDC180Q9P1Z9 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
CCDC180Q9P1Z9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
CCDC180Q9P1Z9 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
CCDC180Q9P1Z9 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
CCDC180Q9P1Z9 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
CCDC180Q9P1Z9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
CCDC180Q9P1Z9 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC37.94■■■■□ 3.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms