Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCHIP1Q9P0W5 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms