Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LTBP3Q9NS15 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LTBP3Q9NS15 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
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