Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB31

SEBOX, Homeobox protein SEBOX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEBOXQ9HB31 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEBOXQ9HB31 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEBOXQ9HB31 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEBOXQ9HB31 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEBOXQ9HB31 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEBOXQ9HB31 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEBOXQ9HB31 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEBOXQ9HB31 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SEBOXQ9HB31 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEBOXQ9HB31 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SEBOXQ9HB31 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEBOXQ9HB31 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEBOXQ9HB31 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEBOXQ9HB31 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEBOXQ9HB31 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEBOXQ9HB31 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEBOXQ9HB31 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEBOXQ9HB31 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEBOXQ9HB31 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEBOXQ9HB31 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEBOXQ9HB31 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEBOXQ9HB31 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEBOXQ9HB31 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEBOXQ9HB31 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEBOXQ9HB31 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEBOXQ9HB31 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEBOXQ9HB31 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEBOXQ9HB31 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SEBOXQ9HB31 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SEBOXQ9HB31 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEBOXQ9HB31 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEBOXQ9HB31 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEBOXQ9HB31 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEBOXQ9HB31 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEBOXQ9HB31 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEBOXQ9HB31 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEBOXQ9HB31 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEBOXQ9HB31 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEBOXQ9HB31 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEBOXQ9HB31 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEBOXQ9HB31 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEBOXQ9HB31 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEBOXQ9HB31 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEBOXQ9HB31 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEBOXQ9HB31 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEBOXQ9HB31 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEBOXQ9HB31 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEBOXQ9HB31 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEBOXQ9HB31 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEBOXQ9HB31 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEBOXQ9HB31 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SEBOXQ9HB31 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SEBOXQ9HB31 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEBOXQ9HB31 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEBOXQ9HB31 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEBOXQ9HB31 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEBOXQ9HB31 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEBOXQ9HB31 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SEBOXQ9HB31 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEBOXQ9HB31 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEBOXQ9HB31 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEBOXQ9HB31 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEBOXQ9HB31 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEBOXQ9HB31 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEBOXQ9HB31 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEBOXQ9HB31 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEBOXQ9HB31 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEBOXQ9HB31 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEBOXQ9HB31 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEBOXQ9HB31 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
SEBOXQ9HB31 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SEBOXQ9HB31 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SEBOXQ9HB31 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SEBOXQ9HB31 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SEBOXQ9HB31 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SEBOXQ9HB31 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SEBOXQ9HB31 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SEBOXQ9HB31 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SEBOXQ9HB31 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SEBOXQ9HB31 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SEBOXQ9HB31 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SEBOXQ9HB31 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEBOXQ9HB31 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms