Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RNF17Q9BXT8 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms