Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW4

SSBP3, Single-stranded DNA-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP3Q9BWW4 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms