Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIOK2Q9BVS4 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms