Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP58Q9BVL2 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms