Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRAMP1Q96RY5 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms