Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPNS2Q96L46 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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