Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
COG3Q96JB2 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms