Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LTV1Q96GA3 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LTV1Q96GA3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms