Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX4

RSPRY1, RING finger and SPRY domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPRY1Q96DX4 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RSPRY1Q96DX4 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RSPRY1Q96DX4 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RSPRY1Q96DX4 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RSPRY1Q96DX4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RSPRY1Q96DX4 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RSPRY1Q96DX4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RSPRY1Q96DX4 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RSPRY1Q96DX4 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RSPRY1Q96DX4 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RSPRY1Q96DX4 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RSPRY1Q96DX4 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RSPRY1Q96DX4 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RSPRY1Q96DX4 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RSPRY1Q96DX4 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RSPRY1Q96DX4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RSPRY1Q96DX4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RSPRY1Q96DX4 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RSPRY1Q96DX4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RSPRY1Q96DX4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RSPRY1Q96DX4 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RSPRY1Q96DX4 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RSPRY1Q96DX4 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RSPRY1Q96DX4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RSPRY1Q96DX4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RSPRY1Q96DX4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RSPRY1Q96DX4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RSPRY1Q96DX4 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RSPRY1Q96DX4 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RSPRY1Q96DX4 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RSPRY1Q96DX4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RSPRY1Q96DX4 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RSPRY1Q96DX4 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RSPRY1Q96DX4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RSPRY1Q96DX4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RSPRY1Q96DX4 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RSPRY1Q96DX4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RSPRY1Q96DX4 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RSPRY1Q96DX4 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RSPRY1Q96DX4 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RSPRY1Q96DX4 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RSPRY1Q96DX4 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RSPRY1Q96DX4 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RSPRY1Q96DX4 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RSPRY1Q96DX4 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RSPRY1Q96DX4 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RSPRY1Q96DX4 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RSPRY1Q96DX4 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RSPRY1Q96DX4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RSPRY1Q96DX4 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RSPRY1Q96DX4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RSPRY1Q96DX4 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RSPRY1Q96DX4 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RSPRY1Q96DX4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RSPRY1Q96DX4 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RSPRY1Q96DX4 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RSPRY1Q96DX4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RSPRY1Q96DX4 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RSPRY1Q96DX4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RSPRY1Q96DX4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RSPRY1Q96DX4 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RSPRY1Q96DX4 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RSPRY1Q96DX4 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RSPRY1Q96DX4 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RSPRY1Q96DX4 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RSPRY1Q96DX4 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RSPRY1Q96DX4 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RSPRY1Q96DX4 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RSPRY1Q96DX4 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RSPRY1Q96DX4 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RSPRY1Q96DX4 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RSPRY1Q96DX4 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RSPRY1Q96DX4 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RSPRY1Q96DX4 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RSPRY1Q96DX4 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RSPRY1Q96DX4 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RSPRY1Q96DX4 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RSPRY1Q96DX4 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RSPRY1Q96DX4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RSPRY1Q96DX4 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RSPRY1Q96DX4 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RSPRY1Q96DX4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RSPRY1Q96DX4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RSPRY1Q96DX4 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RSPRY1Q96DX4 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RSPRY1Q96DX4 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RSPRY1Q96DX4 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RSPRY1Q96DX4 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RSPRY1Q96DX4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RSPRY1Q96DX4 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RSPRY1Q96DX4 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RSPRY1Q96DX4 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RSPRY1Q96DX4 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RSPRY1Q96DX4 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RSPRY1Q96DX4 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RSPRY1Q96DX4 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RSPRY1Q96DX4 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RSPRY1Q96DX4 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RSPRY1Q96DX4 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RSPRY1Q96DX4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms