Protein–RNA interactions for Protein: Q96AG4

LRRC59, Leucine-rich repeat-containing protein 59, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC59Q96AG4 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC59Q96AG4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC59Q96AG4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC59Q96AG4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC59Q96AG4 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC59Q96AG4 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC59Q96AG4 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC59Q96AG4 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC59Q96AG4 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC59Q96AG4 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC59Q96AG4 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC59Q96AG4 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC59Q96AG4 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC59Q96AG4 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC59Q96AG4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC59Q96AG4 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC59Q96AG4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC59Q96AG4 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC59Q96AG4 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC59Q96AG4 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC59Q96AG4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC59Q96AG4 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC59Q96AG4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC59Q96AG4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC59Q96AG4 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC59Q96AG4 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC59Q96AG4 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC59Q96AG4 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC59Q96AG4 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC59Q96AG4 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC59Q96AG4 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC59Q96AG4 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC59Q96AG4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC59Q96AG4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC59Q96AG4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC59Q96AG4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC59Q96AG4 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC59Q96AG4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC59Q96AG4 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC59Q96AG4 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC59Q96AG4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC59Q96AG4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC59Q96AG4 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC59Q96AG4 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC59Q96AG4 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC59Q96AG4 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms