Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
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GTF3C6Q969F1 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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GTF3C6Q969F1 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF3C6Q969F1 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
GTF3C6Q969F1 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
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