Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
PRG4Q92954 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRG4Q92954 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms