Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD9

CASKIN1, Caskin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKIN1Q8WXD9 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CASKIN1Q8WXD9 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CASKIN1Q8WXD9 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CASKIN1Q8WXD9 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CASKIN1Q8WXD9 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CASKIN1Q8WXD9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CASKIN1Q8WXD9 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CASKIN1Q8WXD9 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CASKIN1Q8WXD9 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CASKIN1Q8WXD9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CASKIN1Q8WXD9 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CASKIN1Q8WXD9 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CASKIN1Q8WXD9 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CASKIN1Q8WXD9 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CASKIN1Q8WXD9 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CASKIN1Q8WXD9 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CASKIN1Q8WXD9 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CASKIN1Q8WXD9 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CASKIN1Q8WXD9 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CASKIN1Q8WXD9 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CASKIN1Q8WXD9 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CASKIN1Q8WXD9 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CASKIN1Q8WXD9 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CASKIN1Q8WXD9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CASKIN1Q8WXD9 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CASKIN1Q8WXD9 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CASKIN1Q8WXD9 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CASKIN1Q8WXD9 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CASKIN1Q8WXD9 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CASKIN1Q8WXD9 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CASKIN1Q8WXD9 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CASKIN1Q8WXD9 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CASKIN1Q8WXD9 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CASKIN1Q8WXD9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CASKIN1Q8WXD9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CASKIN1Q8WXD9 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CASKIN1Q8WXD9 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CASKIN1Q8WXD9 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CASKIN1Q8WXD9 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CASKIN1Q8WXD9 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CASKIN1Q8WXD9 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CASKIN1Q8WXD9 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CASKIN1Q8WXD9 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CASKIN1Q8WXD9 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CASKIN1Q8WXD9 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CASKIN1Q8WXD9 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CASKIN1Q8WXD9 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CASKIN1Q8WXD9 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CASKIN1Q8WXD9 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CASKIN1Q8WXD9 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CASKIN1Q8WXD9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CASKIN1Q8WXD9 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CASKIN1Q8WXD9 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CASKIN1Q8WXD9 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CASKIN1Q8WXD9 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CASKIN1Q8WXD9 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CASKIN1Q8WXD9 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CASKIN1Q8WXD9 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CASKIN1Q8WXD9 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CASKIN1Q8WXD9 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CASKIN1Q8WXD9 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CASKIN1Q8WXD9 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CASKIN1Q8WXD9 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CASKIN1Q8WXD9 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CASKIN1Q8WXD9 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CASKIN1Q8WXD9 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CASKIN1Q8WXD9 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CASKIN1Q8WXD9 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CASKIN1Q8WXD9 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CASKIN1Q8WXD9 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CASKIN1Q8WXD9 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CASKIN1Q8WXD9 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CASKIN1Q8WXD9 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CASKIN1Q8WXD9 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CASKIN1Q8WXD9 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CASKIN1Q8WXD9 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CASKIN1Q8WXD9 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CASKIN1Q8WXD9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CASKIN1Q8WXD9 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CASKIN1Q8WXD9 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms