Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2E2

VWDE, von Willebrand factor D and EGF domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWDEQ8N2E2 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms