Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPAP2Q8IXW5 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPAP2Q8IXW5 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms