Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT28Q7Z3Y7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT28Q7Z3Y7 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms