Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms