Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV77

C9orf139, Uncharacterized protein C9orf139, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf139Q6ZV77 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.05■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.05■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.05■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf139Q6ZV77 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms