Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUP7

PPP4R4, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4Q6NUP7 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPP4R4Q6NUP7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms