Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HMBOX1Q6NT76 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms