Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STRIP1Q5VSL9 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms