Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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