Protein–RNA interactions for Protein: Q2Y0W8

SLC4A8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A8Q2Y0W8 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A8Q2Y0W8 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A8Q2Y0W8 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A8Q2Y0W8 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A8Q2Y0W8 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A8Q2Y0W8 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC4A8Q2Y0W8 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC4A8Q2Y0W8 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC4A8Q2Y0W8 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC4A8Q2Y0W8 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A8Q2Y0W8 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms