Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
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PTPRNQ16849 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRNQ16849 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRNQ16849 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRNQ16849 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRNQ16849 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRNQ16849 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRNQ16849 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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PTPRNQ16849 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRNQ16849 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRNQ16849 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRNQ16849 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
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PTPRNQ16849 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRNQ16849 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
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PTPRNQ16849 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRNQ16849 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRNQ16849 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRNQ16849 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRNQ16849 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRNQ16849 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
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PTPRNQ16849 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRNQ16849 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRNQ16849 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRNQ16849 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
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PTPRNQ16849 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRNQ16849 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRNQ16849 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRNQ16849 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRNQ16849 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRNQ16849 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRNQ16849 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRNQ16849 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRNQ16849 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRNQ16849 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRNQ16849 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRNQ16849 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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PTPRNQ16849 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
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PTPRNQ16849 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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PTPRNQ16849 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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PTPRNQ16849 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRNQ16849 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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PTPRNQ16849 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
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PTPRNQ16849 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRNQ16849 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRNQ16849 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRNQ16849 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRNQ16849 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRNQ16849 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRNQ16849 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRNQ16849 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRNQ16849 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRNQ16849 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRNQ16849 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
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