Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DDR2Q16832 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DDR2Q16832 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DDR2Q16832 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DDR2Q16832 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DDR2Q16832 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DDR2Q16832 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DDR2Q16832 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DDR2Q16832 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DDR2Q16832 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DDR2Q16832 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DDR2Q16832 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DDR2Q16832 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DDR2Q16832 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DDR2Q16832 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DDR2Q16832 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DDR2Q16832 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DDR2Q16832 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DDR2Q16832 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
DDR2Q16832 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DDR2Q16832 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DDR2Q16832 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DDR2Q16832 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DDR2Q16832 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DDR2Q16832 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DDR2Q16832 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DDR2Q16832 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DDR2Q16832 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DDR2Q16832 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DDR2Q16832 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DDR2Q16832 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DDR2Q16832 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DDR2Q16832 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
DDR2Q16832 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DDR2Q16832 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
DDR2Q16832 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DDR2Q16832 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DDR2Q16832 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DDR2Q16832 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
DDR2Q16832 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
DDR2Q16832 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DDR2Q16832 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
DDR2Q16832 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
DDR2Q16832 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
DDR2Q16832 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DDR2Q16832 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DDR2Q16832 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DDR2Q16832 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DDR2Q16832 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DDR2Q16832 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DDR2Q16832 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DDR2Q16832 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DDR2Q16832 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DDR2Q16832 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DDR2Q16832 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DDR2Q16832 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DDR2Q16832 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DDR2Q16832 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DDR2Q16832 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
DDR2Q16832 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DDR2Q16832 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DDR2Q16832 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DDR2Q16832 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DDR2Q16832 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DDR2Q16832 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DDR2Q16832 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DDR2Q16832 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DDR2Q16832 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DDR2Q16832 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DDR2Q16832 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
DDR2Q16832 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DDR2Q16832 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DDR2Q16832 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DDR2Q16832 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DDR2Q16832 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DDR2Q16832 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DDR2Q16832 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
DDR2Q16832 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DDR2Q16832 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DDR2Q16832 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DDR2Q16832 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DDR2Q16832 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DDR2Q16832 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DDR2Q16832 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DDR2Q16832 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DDR2Q16832 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DDR2Q16832 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DDR2Q16832 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DDR2Q16832 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DDR2Q16832 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DDR2Q16832 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DDR2Q16832 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DDR2Q16832 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DDR2Q16832 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DDR2Q16832 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DDR2Q16832 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DDR2Q16832 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DDR2Q16832 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DDR2Q16832 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DDR2Q16832 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
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