Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NFIXQ14938 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
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