Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

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Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CKAP5Q14008 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CKAP5Q14008 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
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