Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX3Q13761 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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