Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PKD2Q13563 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PKD2Q13563 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PKD2Q13563 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PKD2Q13563 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PKD2Q13563 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PKD2Q13563 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PKD2Q13563 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PKD2Q13563 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PKD2Q13563 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PKD2Q13563 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PKD2Q13563 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PKD2Q13563 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PKD2Q13563 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PKD2Q13563 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PKD2Q13563 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PKD2Q13563 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PKD2Q13563 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PKD2Q13563 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PKD2Q13563 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PKD2Q13563 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PKD2Q13563 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PKD2Q13563 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PKD2Q13563 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PKD2Q13563 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PKD2Q13563 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PKD2Q13563 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PKD2Q13563 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PKD2Q13563 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PKD2Q13563 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PKD2Q13563 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PKD2Q13563 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PKD2Q13563 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PKD2Q13563 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PKD2Q13563 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PKD2Q13563 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PKD2Q13563 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PKD2Q13563 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PKD2Q13563 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PKD2Q13563 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PKD2Q13563 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PKD2Q13563 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PKD2Q13563 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PKD2Q13563 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PKD2Q13563 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PKD2Q13563 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PKD2Q13563 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PKD2Q13563 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PKD2Q13563 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PKD2Q13563 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PKD2Q13563 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PKD2Q13563 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PKD2Q13563 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PKD2Q13563 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PKD2Q13563 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PKD2Q13563 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PKD2Q13563 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PKD2Q13563 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PKD2Q13563 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PKD2Q13563 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms