Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRQ13535 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRQ13535 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRQ13535 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRQ13535 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRQ13535 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRQ13535 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRQ13535 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRQ13535 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRQ13535 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATRQ13535 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATRQ13535 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATRQ13535 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATRQ13535 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATRQ13535 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ATRQ13535 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ATRQ13535 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATRQ13535 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATRQ13535 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATRQ13535 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATRQ13535 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATRQ13535 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATRQ13535 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATRQ13535 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATRQ13535 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATRQ13535 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ATRQ13535 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATRQ13535 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATRQ13535 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATRQ13535 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATRQ13535 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATRQ13535 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATRQ13535 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATRQ13535 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATRQ13535 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATRQ13535 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATRQ13535 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATRQ13535 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ATRQ13535 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATRQ13535 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATRQ13535 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATRQ13535 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATRQ13535 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATRQ13535 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATRQ13535 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATRQ13535 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATRQ13535 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATRQ13535 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATRQ13535 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATRQ13535 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRQ13535 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRQ13535 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRQ13535 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRQ13535 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRQ13535 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRQ13535 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRQ13535 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRQ13535 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRQ13535 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRQ13535 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRQ13535 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRQ13535 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRQ13535 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRQ13535 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRQ13535 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRQ13535 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRQ13535 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRQ13535 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRQ13535 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRQ13535 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRQ13535 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRQ13535 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRQ13535 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRQ13535 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRQ13535 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRQ13535 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRQ13535 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRQ13535 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRQ13535 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRQ13535 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRQ13535 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRQ13535 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRQ13535 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRQ13535 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRQ13535 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRQ13535 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRQ13535 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRQ13535 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATRQ13535 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRQ13535 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRQ13535 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRQ13535 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRQ13535 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRQ13535 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRQ13535 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRQ13535 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRQ13535 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRQ13535 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRQ13535 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATRQ13535 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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